Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb1P28230 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms