Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjc1P28229 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjc1P28229 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms