Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CebpbP28033 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms