Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde6aP27664 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms