Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CftrP26361 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CftrP26361 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CftrP26361 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CftrP26361 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CftrP26361 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CftrP26361 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CftrP26361 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CftrP26361 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CftrP26361 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CftrP26361 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CftrP26361 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CftrP26361 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CftrP26361 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CftrP26361 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CftrP26361 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CftrP26361 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CftrP26361 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CftrP26361 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CftrP26361 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CftrP26361 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CftrP26361 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CftrP26361 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CftrP26361 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CftrP26361 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CftrP26361 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CftrP26361 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CftrP26361 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CftrP26361 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CftrP26361 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CftrP26361 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CftrP26361 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CftrP26361 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CftrP26361 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CftrP26361 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CftrP26361 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CftrP26361 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CftrP26361 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CftrP26361 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CftrP26361 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CftrP26361 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CftrP26361 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CftrP26361 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CftrP26361 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CftrP26361 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CftrP26361 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CftrP26361 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CftrP26361 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CftrP26361 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CftrP26361 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CftrP26361 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CftrP26361 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CftrP26361 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CftrP26361 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CftrP26361 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CftrP26361 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CftrP26361 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CftrP26361 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CftrP26361 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CftrP26361 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CftrP26361 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CftrP26361 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CftrP26361 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CftrP26361 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CftrP26361 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CftrP26361 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CftrP26361 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CftrP26361 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CftrP26361 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CftrP26361 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CftrP26361 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CftrP26361 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CftrP26361 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CftrP26361 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CftrP26361 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CftrP26361 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CftrP26361 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CftrP26361 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CftrP26361 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CftrP26361 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CftrP26361 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CftrP26361 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CftrP26361 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CftrP26361 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CftrP26361 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CftrP26361 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CftrP26361 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CftrP26361 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CftrP26361 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CftrP26361 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms