Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra2P26048 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms