Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NdnP25233 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NdnP25233 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NdnP25233 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NdnP25233 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NdnP25233 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NdnP25233 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NdnP25233 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NdnP25233 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NdnP25233 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NdnP25233 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NdnP25233 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NdnP25233 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NdnP25233 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NdnP25233 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NdnP25233 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NdnP25233 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms