Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
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