Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd12P23812 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 486.4 ms