Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfyaP23708 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfyaP23708 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms