Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkchP23298 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkchP23298 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkchP23298 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkchP23298 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms