Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gadd45bP22339 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gadd45bP22339 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms