Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms