Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcb1aP21447 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms