Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klra1P20937 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Klra1P20937 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klra1P20937 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klra1P20937 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms