Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms