Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou5f1P20263 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms