Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PdgfaP20033 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms