Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms