Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc1P18828 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms