Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18530 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18530 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18530 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18530 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18530 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18530 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18530 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms