Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18528 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P18528 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18528 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18528 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18528 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18528 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18528 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18528 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms