Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd5P13379 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd5P13379 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms