Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms