Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb1P12658 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb1P12658 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb1P12658 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb1P12658 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calb1P12658 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms