Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp1P11438 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lamp1P11438 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms