Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp1P11103 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp1P11103 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp1P11103 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp1P11103 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp1P11103 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp1P11103 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp1P11103 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp1P11103 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp1P11103 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms