Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nid1P10493 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nid1P10493 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nid1P10493 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms