Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P10404 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P10404 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P10404 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P10404 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P10404 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P10404 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P10404 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P10404 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P10404 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P10404 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P10404 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P10404 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P10404 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P10404 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms