Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6c1P0CW02 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms