Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pla2g4bP0C871 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms