Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms