Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms