Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NeflP08551 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NeflP08551 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NeflP08551 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NeflP08551 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NeflP08551 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NeflP08551 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NeflP08551 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NeflP08551 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NeflP08551 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NeflP08551 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NeflP08551 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NeflP08551 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NeflP08551 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NeflP08551 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NeflP08551 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NeflP08551 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NeflP08551 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NeflP08551 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NeflP08551 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NeflP08551 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NeflP08551 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NeflP08551 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms