Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr1P08046 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr1P08046 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Egr1P08046 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Egr1P08046 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms