Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spta1P08032 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spta1P08032 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms