Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms