Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06330 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06330 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06330 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06330 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06330 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06330 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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