Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P06323 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06323 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06323 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06323 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06323 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06323 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06323 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06323 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06323 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06323 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06323 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06323 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06323 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06323 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06323 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms