Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTNP04004 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTNP04004 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VTNP04004 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VTNP04004 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VTNP04004 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTNP04004 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTNP04004 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTNP04004 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTNP04004 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTNP04004 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTNP04004 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTNP04004 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTNP04004 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTNP04004 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTNP04004 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTNP04004 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTNP04004 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTNP04004 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTNP04004 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTNP04004 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTNP04004 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTNP04004 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTNP04004 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTNP04004 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTNP04004 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTNP04004 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTNP04004 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTNP04004 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTNP04004 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTNP04004 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VTNP04004 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VTNP04004 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTNP04004 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTNP04004 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTNP04004 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTNP04004 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTNP04004 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms