Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Ab1P01921 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Ab1P01921 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms