Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01915 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01915 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01915 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01915 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01915 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01915 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01915 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01915 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01915 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01915 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms