Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01801 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01801 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01801 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01801 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01801 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01801 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01801 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01801 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms