Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01798 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01798 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01798 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01798 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01798 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01798 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01798 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms