Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01658 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01658 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01658 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01658 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01658 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01658 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01658 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms