Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01649 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01649 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01649 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01649 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01649 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01649 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01649 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01649 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01649 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01649 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01649 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01649 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01649 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01649 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01649 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01649 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01649 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01649 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01649 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01649 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01649 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01649 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01649 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms