Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp8O89110 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casp8O89110 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Casp8O89110 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Casp8O89110 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Casp8O89110 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms