Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sypl2O89104 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sypl2O89104 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sypl2O89104 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sypl2O89104 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sypl2O89104 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sypl2O89104 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sypl2O89104 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sypl2O89104 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sypl2O89104 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sypl2O89104 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms