Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms