Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms