Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tom1O88746 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tom1O88746 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tom1O88746 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tom1O88746 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tom1O88746 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tom1O88746 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tom1O88746 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tom1O88746 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tom1O88746 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tom1O88746 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms